男性性功能障礙主要有3種分類法。
①按病因分類。分為器質性與功能性（非器質性、精神心理性）兩種，器質性性功能障礙 ，是指機體某個器官或系統發生病理性改變而導緻的性功能障礙，如腦瘤、脊柱骨折、截癱、動脈硬化、睾丸發育不良性腺機能低下、甲狀腺機能亢進或低下、嚴重的尿道下裂或尿道上裂、服用一些神經抑制性藥物等。功能性性功能障礙，是指在機體上找不到器質性病變，性功能障礙多是由于性知識不足、精神上的創傷、夫妻關系不協調、環境不适當造成、或由于醫源性的原因，如由于偶然性交失敗，被醫生誤診為陽痿而加重了精神負擔造成的勃起障礙等。
②按性功能障礙發生的時間分類。分為原發性作功能障礙（從首次性接觸就開始有性功能障礙）及繼發性性功能障礙（既往性功能良好，以後才發生性功能障礙）。
③境遇性性功能障礙。
對某個人或在某種環境下發生性功能障礙，而對其他人或另種環境下，則性功能完全正常。由于精神心理因素造成。人類的性活動是涉及多方面複雜的心理與生理過程，往往是心理性與器質性因素相互作用。心理性性功能障礙當然要按其發病原因做心理分析、疏導與性教胄。器質性性功能障礙，隻治療器質性病變而忽略了精神心理方面的疏導，同樣也得不到應有的療效。
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