沙塵暴和霧霾有着本質的區别，沙塵暴是以地面揚起的沙塵為主要顆粒物的氣象災害，其中顆粒物成分主要是二氧化矽，而霧霾則主要是工農業生産過程中産生的空氣污染，其中的顆粒物的成分是以炭黑為核心，附着各種各樣的有機化合物和微生物。
二者的直徑有區别，大家知道，顆粒物對身體和肺的損害和顆粒物的直徑有非常大的關系，顆粒物直徑越大越不容易到達肺的深處，很容易被阻隔在上呼吸道和大的氣道，并被痰液粘附咳出體外，咳不出來的就可能被巨噬細胞吞噬并固定，這也是肺部結節形成的原因之一，如果是長期在沙塵環境中工作并且不注意防護，有形成塵肺的危險。霧霾則是以PM2.5為主要顆粒直徑，這樣的顆粒物大部分可以直達肺的深處，進入肺泡，其中的一些有毒有害有機物可能在肺泡和終末細支氣管沉積并對局部造成甚遠的影響，這些有機物可以直接損害肺泡的免疫屏障，造成局部免疫力低下，而大部分PM2.5表面都附着病原體，很容易在受損傷的肺泡局部生長并形成感染竈，這是顆粒物引起很多肺部疾病急性加重的原因。
從損傷的方式來看，沙塵對于肺泡的損傷多是以物理損傷為主，其表面附着的少量有機物并不足以引起肺泡和支氣管的嚴重損傷，但顆粒物的長期大量沉積也會形成諸如塵肺結節這樣的嚴重損傷，PM2.5則以化學損傷為主，毒物可能損及細胞的基因，造成基因損傷，進而影響細胞的蛋白表達，産生功能異常，甚至有緻癌的可能性，更加嚴重的是，PM2.5可能進入吞噬細胞并随之入血全身轉移，有人在中樞腦神經系統中也曾發現過PM2.5存在的證據。
沙塵和霧霾對人體都有影響，但相對來說霧霾更加頻繁的出現在城市生活中，且損傷更加久遠，是呼吸系統疾病的重要威脅。
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