circRNA紅透天際，引得一衆科學家競相追逐。然而眼下cirRNA研究的一個巨大挑戰就是，可參考信息不多，數據庫建設相比其他非編碼（miRNA，lncRNA）相對稚嫩。

而數據庫使用教程更是稀少，質量參差不齊，細緻清晰可重複簡直就是奢望，學習成本很高。

解螺旋的單元課一直秉承“喂到嘴邊”的傻瓜教程理念，精心挑選cirRNA研究7大數據庫，從基礎研究到臨床樣本，涉及腫瘤和非腫瘤疾病數據，全方位武裝頭腦，讓你對circRNA了如指掌！

circRNADisease數據庫

表達有差異是功能意義的前提，如何挑選出文章主變量是研究的第一步。說到如何挑選主變量，怎能跳過CircRNADisease？

circRNADisease數據庫基于800多篇報道circRNA與疾病相關的文獻，收集了330個circRNA與48種疾病之間的354對相互聯系，其中腫瘤相關疾病占54%，心血管和腦血管相關疾病占27%。

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circBase數據庫

尋找到研究主變量後，查詢其詳細信息，在不同物種中的表達情況，是circRNA研究必需環節，此時circBase就派上用場了。它收集和整合基于測序數據發現的circRNA，目前包含人類、小鼠、秀麗線蟲、黑腹果蠅、矛尾魚和腔棘魚等物種的circRNA信息，是circRNA研究比較基礎和老牌的數據庫。

CircInteractome數據庫

CircRNA因其環狀的特殊性，使其在引物設計，機制的探索研究中比其他的非編碼RNA都難度更高。

CircRNA目前報道的機制多為ceRNA和cicRNA與蛋白結合。circinteractome數據庫是circRNA機制研究集大成者，它整合了109個RNA-bindingproteins（RBPs）數據集并預測了circRNA與RBP結合的位點，此外該數據庫還整合了TargetScan數據庫信息。

它的主要優勢在于預測circRNA與RBP或miRNA的結合情況，設計DivergentPCR引物，設計circRNA特異性的siRNA。

Tissue-Specific CircRNA Database（TSCD）數據庫

TSCD是檢索人和小鼠中組織特異性的circRNA信息的數據庫，包括成人和胚胎的不同組織。

它基于ENCODE數據庫和NCBIGEO數據庫的RNA-seq數據，收集了成年人類16個組織，人類胚胎15個組織，小鼠9個組織中特異性表達的circRNA。

MiOncoCirc數據庫

MiOncoCirc數據庫是首個以臨床腫瘤樣本為基礎的circRNA數據庫，包含了2000多個臨床腫瘤樣本中的circRNA表達信息，收集了豐富的原位癌、轉移癌及一些罕見癌症類型的circRNA表達數據。

由于其中的circRNA數據來源于臨床腫瘤樣本，因此能夠更好地表征與癌症相關的真實的circRNA特征。

Cancer-Specific CircRNA Database（CSCD）數據庫

CSCD也是一個腫瘤特異的circRNA數據庫，由87個腫瘤細胞系中獲得的228個RNA-seq數據整合而成，并整合了4種常用的circRNA分析算法的結果，目前包含272152個腫瘤特異性表達的circRNA信息。

該數據庫主要優勢在于circRNA數據量更加豐富，可根據腫瘤細胞系，基因名或亞細胞定位定向檢索circRNA。也可獲取檢索到的與circRNA結合的miRNA，RBP及ORF（開放閱讀框）等相關信息

exoRBase數據庫

exoRBase數據庫基于外周血中外泌體的RNA-seq數據庫和已報道的相關文獻資料中的數據，收集了包括circRNA，lncRNA和mRNA的表達數據，包括正常個體和多種疾病患者的RNA-seq數據。它可以檢索多種疾病中分析人血液外泌體中某種circRNA，lncRNA或mRNA的表達水平，并獲得可視化圖形。