秦莊襄王與呂不韋的君臣關系确實非同尋常，但是他們之間還有一層隐密關系，這就是秦始皇的母親與秦始皇。

據司馬遷《史記.呂不韋列傳》記載:當年呂不韋在趙國邯鄲時，娶了一位能歌善舞的絕世美人邯鄲姬，與之同居，已經懷孕。有一次公子異人與呂不韋一起飲酒，酒筵上呂不韋一時高興，喚來邯鄲姬跳舞助興。公子異人一眼就看中了呂不韋這個如花似玉的美妾，請求轉讓給他作夫人。呂不韋一聽十分惱火，但轉念一想，為了異人，千金家産都已破費，何在乎區區一妾，更不能為争風吃醋壞了大事，于是将邯鄲姬獻給了公子異人作夫人。

這位邯鄲美人，能歌善舞，原本是在風月場混慣了的，她對異人隐瞞了自己已經懷孕之事,過了十二個月，在公元前二五九年正月生下一個男孩，因為是在趙國正月出生,所以取名為正(或作政)，由于秦趙同宗,又是趙國出生，所以又以趙為氏，叫做趙正。又因秦是赢姓，後也稱赢政。這個初名趙正的男孩就是後來的千古之一帝秦始皇。

對于司馬遷《史記》上的這段記載，兩千年來廣泛流傳，人們深信不疑。但是，也有些史學家認為秦始皇是呂不韋的私生子一說不可靠。明代學者湯聘尹認為這個傳說是“戰國好事者為之”《史神》，不可相信。明代史學家王世貞在《讀書後記》中引舉了兩種說法:一種認為說秦始皇是呂不韋的私生子，是呂不韋故意散布的謊言，目的在于暗示秦始皇知道，他才是秦始皇的生身親父，借此永保自己的榮華富貴。另一種認為罵秦始皇是私生子,是呂不韋的門客們洩私憤,目的在于使天下人知道秦國比六國先亡。但這些觀點僅僅是推測，并沒有确鑿的依據。

郭沫若先生在《十批判書》中，也對這個問題進行了質疑和考證，認為“秦始皇是呂不韋的兒子的話，确實是莫須有的事”(《呂不韋與秦王政的批判》)。因為說秦始皇是呂不韋的私生子，僅見于《史記》，而《戰國策》上不曾記載，且再無其它旁證;其次，《史記.呂不韋列傳》本文也互相矛盾，前邊寫了異人奪呂不韋之妾邯鄲姬立為夫人，後邊又記載“子楚夫人趙豪家女也”,這講不通;再者，《史記》還記載邯鄲姬“至大期時，生子政。”

按照《索隐》引徐廣注，“大期”是超過了十二個月，按谯周注釋“大期”是超過十個月，這顯然也是說不通的。如果說邯鄲姬懷孕時間不足十月生子,那麼尚可說她與呂不韋私通先孕,但過了十二個月，按照科學觀點分析，顯然是站不住腳的。因此，郭沫若先生推測這種說法是西漢初年，呂後稱制時諸呂編造的，目的在于認呂不韋為族祖，說明天下本是呂家的天下，被劉家奪去，呂家應再奪回，為呂氏稱制而制造輿論。

到了公元前二四七年，繼承王位剛剛三年的秦莊襄王就又病死了，這一年太子赢政已經十三歲，呂不韋就擁立嬴政做國王，稱為秦王政，他自己繼續任相國，年輕的秦王政稱呂不韋為“仲父”，讓他總理全國政務。

2000多年來秦王政身世說法不一，至今仍是千古未解之謎。