所謂轉基因食品， 就是通過基因工程技術将一種或幾種外源性基因轉移到某種特定的生物體中，并使其有效地表達出相應的産物（多肽或蛋白質），此過程叫轉基因。以轉基因生物為原料加工生産的食品就是轉基因食品。

根據轉基因食品來源的不同可分為植物性轉基因食品，動物性轉基因食品和微生物性轉基因食品。

從世界上最早的轉基因作物（煙草）于1983年誕生，到美國孟山都公司轉基因食品研制的延熟保鮮轉基因西紅柿1994年在美國批準上市，轉基因食品的研發迅猛發展，産品品種及産量也成倍增長，轉基因作為一種新興的生物技術手段，它的不成熟和不确定性，使得轉基因食品的安全性成為人們關注的焦點。

國際社會上，截至2010年，美國的小麥主糧的商業化尚未推開，日本禁止進口美國轉基因大米，印度停止轉基因茄子商業化。

優點

轉基因食品有較多的優點：可增加作物産量；可以降低生産成本；可增強作物抗蟲害、抗病毒等的能力；提高農産品耐貯性。

例如：轉基因食品——土豆；縮短作物開發的時間；擺脫四季供應；打破物種界限，不斷培植新物種，生産出有利于人類健康的食品。

缺點

轉基因食品也有缺點：所謂的增産是不受環境影響的情況下得出的，如果遇到雨雪的自然災害，也有可能減産更厲害。同時在栽培過程中，轉基因作物可能演變為農田雜草；可能通過基因漂流影響其他物種；轉基因食品可能會引起過敏等。

毒性

宣傳闆表現了轉基因食品的安全性擔憂

許多食品生物本身就能産生大量的毒性物質和營養因子，如蛋白質抑制劑、溶血栓、神經毒素等以抵抗病原菌和害蟲的入侵。現有食品中毒素含量并不一定會引起毒效應，當然如果處理不當，某些食品（如木薯）能引起嚴重的生理問題甚至死亡。在轉基因食品加工過程中由于基因的導入使得毒素蛋白發生過量表達，産生各種毒性，從理論上講任何基因轉入的方法都可能導緻遺傳工程體（GMO）産生不可預知的變化，包括多向效應。

食品過敏性

國内反對轉基因大米條幅

食品過敏是一個世界性的公共衛生問題。據估計有近2%的成年人和4.6%的兒童患有食物過敏。轉基因作物通常插入特定的基因片段以表達特定的蛋白，而所表達的蛋白如果是已知過敏源，則有可能引起人類的不良反應，即使表達蛋白為非已知過敏源，但隻要是在轉基因作物的食用部分表達，則也需對其進行評估。

抗生素抗性

轉基因食品對人類健康的另一個安全問題是抗生素标記基因。抗生素标記基因是與插入的目的基因一起轉入目标作物中，用于幫助在植物遺傳轉化篩選和鑒定轉化的細胞、組織和再生植株。标記基因本身并無安全性問題，有争議的一個問題是會有基因水平轉移的可能性。如抗生素标記基因是否會水平轉移到腸道被腸道微生物所利用，産生抗生素抗性，從而降低抗生素在臨床治療中的有效性。

營養價值

下降或造成體内營養素紊亂，人為改變了蛋白質組成的食物是否被能人體有效地吸收利用。有人認為，導緻轉基因食品安全性問題的關鍵因素是外源基因的導入位點和外源蛋白質的表達。由于外源基因的來源、導入位點的不同，以及具有随機性，極有可能産生基因缺失、錯碼等突變，使所表達的蛋白質産物的性狀、數量及部位與期望值不符。

由于轉基因食品中有些成分是傳統食品中從來沒有的。現代生物技術将其他生物基因轉入植物，将病毒、細菌和非食物品種的外源基因，以及标記基因中的抗生素抗性基因等引入食用作物，都是傳統育種技術無法實現的。再者，現代遺傳工程學還比較年輕，誰也說不清這些遺傳改變将來會産生什麼後果。因此，各國對這類食品的安全檢驗要求比用傳統方法培育生産的更加嚴格。截至2013年，國際上普遍采用的是以實質等同性原則為依據的安全性評價方法。

實質等同性原則

1993年，經濟合作與發展組織（OECD）首次提出了實質等同性原則。OECD 認為，以實質等同性為基礎的安全性評價，是說明現代生物技術生産的食品和食品成分安全性最實際的方法。1996年FAO和WHO 的專家咨詢會議建議“以實質等同性原則為依據的安全性評價，可以用于評價GM生物衍生的食品和食品成分的安全性。”實質等同性可以證明轉基因食品并不比傳統食品不安全，但并不證明它是絕對安全的，因為證明絕對安全是不切實際的。

會議将實質等同性分為以下三類：

（1）與傳統食品和食品成分具有等同性；

（2）除某些特定差異外，與傳統食品和食品成分具有等同性；

（3）與傳統食品和食品成分無實質等同性；

轉基因食品安全性評價程序

實質等同性是安全性評價程序執行前的指導原則，完整食品全面安全性評價的要點是：

（1）親本（宿主）作物的安全食用曆史、成分、營養、毒性物質、抗營養素等。

（2）供體基因的安全使用曆史、基因組合的分子特性和插入到宿主基因組性質和标記基因，考慮到基因的水平轉移和DNA 安全性。

（3）基因産物危害性的評估數據，包括毒物學和過敏性。

通過對“開始材料”安全性情況的深入評價和在轉化過程的綜合評價，為了保證新作物和傳統的對應物“一樣安全”，還必須按照實質等同性原則，對轉基因作物的表型和農藝學性狀、成分、全面全性、營養和飼養性等方面的等同性進行綜合評價，證明它們和傳統對應物是等同的。各國用這個方法評價了50多種GM作物，結論是，由GM作物産生的食品和飼料，和傳統作物産生的都是一樣安全和營養的。