1、枯草芽孢杆菌：增加作物抗逆性、固氮。

2、地衣芽孢杆菌：抗病、殺滅有害菌。

3、解澱粉芽孢杆菌：分泌抗菌物質，産生拮抗作用，營養與空間的競争，誘導寄主産生抗性和促進植物生長。

4、巨大芽孢杆菌：解磷（磷細菌），具有很好的降解土壤中有機磷的功效。

5、 膠凍樣芽孢杆菌：解鉀，釋放出可溶磷鉀元素及鈣、硫、鎂、鐵、鋅、钼、錳等中微量元素。

6、側孢芽孢杆菌：促根、殺菌及降解重金屬。

7、膠質芽孢杆菌：有溶磷、釋鉀和固氮功能，分泌多種酶，增強作物對一些病害的抵抗力。

8、泾陽鍊黴菌：具有增強土壤肥力、刺激作物生長的能力。

9、菌根真菌：擴大根系吸收面，增加對原根毛吸收範圍外的元素（特别是磷）的吸收能力。

10、棕色固氮菌：固定空氣中的遊離氮，增産。

11、圓褐固氮菌：固氮、提高作物産量。

12、放線菌：拮抗病原菌防病壯菌的作用，分泌細胞分裂素促進作物的生長。

13、光合菌群：合成糖類、氨基酸類、維生素類、氮素化合物、抗病毒物質和生理活性物質等，是肥沃土壤和促進動植物生長的主力部隊。

14、乳酸菌群：具有很強的殺菌能力，能有效抑制有害微生物的活動和有機物的急劇腐敗分解，能夠分解在常态下不易分解的木質素和纖維素，并使有機物發酵分解。乳酸菌還能夠抑制連作障礙産生的緻病菌增殖。

15、酵母菌群：合成促進根系生長及細胞分裂的活性化物質，促進其它有效微生物增殖所需要的基質(食物)提供重要的給養保障。

16、凝結芽孢杆菌：可降低環境中的氨氣、硫化氫等有害氣體。提高果實中氨基酸的含量。

17、米曲黴：使稭稈中的有機質成為植物生長所需的營養，提高土壤有機質，改善土壤結構。分解蛋白質、纖維素、半纖維素、木質素等，并将嗜熱、耐熱細菌、真菌、酵母菌菌株及相關分解酶複合而成，降解能力強，同時能夠達到升溫、除臭、消除病蟲害、雜草種子和提高養分的效果。

18、黑曲黴：裂解大分子有機物和難溶無機物，便于作物吸收利用，改善土壤結構，增強土壤肥力，提高作物産量。

19、綠色木黴：是所産纖維素酶活性最高的菌株之一，所産生的纖維素酶對作物有降解作用，效果非常好，同時又是一種資源豐富的拮抗微生物，具有保護和治療雙重功效，可有效防治土傳性病害。

20、哈茨木黴：用來預防由腐黴菌、立枯絲核菌、鐮刀菌、黑根黴、柱孢黴、核盤菌、齊整小核菌等病原菌引起的植物病害。

21、淡紫拟青黴：對多種線蟲都有防治效能，是防治根結線蟲最有前途的生防制劑。

22、白僵菌：在自然條件通過體壁接觸感染殺死害蟲。

23、綠僵菌：能夠寄生于多種害蟲的一類殺蟲真菌，通過體表入侵作用進入害蟲體内，在害蟲體内不斷增繁殖通過消耗營養、機械穿透、産生毒素，并不斷在害蟲種群中傳播，使害蟲緻死。

24、EM菌：由雙岐菌、乳酸菌、芽孢杆菌(地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、膠質芽孢杆菌、蘇雲金芽孢杆菌等)、光合細菌、酵母菌、放線菌、醋酸菌等單一菌種經特殊工藝單獨擴培、發酵、噴霧幹燥而成的高效複合微生物菌種

25、丁酸梭菌：丁酸梭菌是農業上的高效解磷菌。解磷微生物通過分泌有機酸和相關酶将土壤中的無效磷轉化為植物可吸收利用的有效磷，在自然界磷素生物地化循環中起到了關鍵性作用。施用解磷微生物來降低農業生産成本、提高作物産量是當前研究的熱點。