左右都督（一品）相當于國家安全委員會的第一第二副主席（正國級），但本身職務是虛職。
錦衣衛指揮使（正三品）相當于國家安全部的部長（正部級），錦衣衛指揮同知（從三品）相當于國安部副部長（副部級），這都是實職。
國安委主要對外，國安部主要對内，都督可以兼任錦衣衛指揮使。（實際上不存在錦衣衛都督這個職務）
錦衣衛僅僅是一個正三品（正部級）單位，但他的權力源于大明皇帝（），所以呢，真正負責人是那個挂“掌錦衣衛事”（主持工作）的。
按國初制度，錦衣衛是個正三品的親軍指揮使司衙門的體統（注意，沒有“都”），其正職長官是正三品的指揮使。但至少從永樂朝的紀（？-1416）開始，随着錦衣衛長官個人官銜的提升，就出現了以正三品都指揮佥事銜掌管錦衣衛的情況，為此皇帝要在提升他們的官銜時加上“仍掌錦衣衛事”的說明。
當然其後的洪宣之世的王節（1424-1435在任）、正統朝的徐恭（1435-1449在任）、景泰初期的劉源（1449-1451在任）都還是以指揮使為錦衣衛長官的，甚至景泰朝後期始終沒有任命錦衣衛指揮使。
成化朝的朱骥（1479-1490在任，于謙的女婿）是最後一位以指揮使銜成為錦衣衛長官的，也是第一位升至正二品都指揮使銜的錦衣衛長官。北京沒有都指揮使司衙門，這些都指揮們隻是提升了本官的級别，領工資和上班都是在錦衣衛，也就是所謂在錦衣衛“帶俸”。
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