故事開始，出現兩個孤兒，呂樹與呂小魚。兩人相依為命，守在破舊的出租屋内生活，日子過得格外貧窮，吃菜靠自己種，經濟來源是賣煮雞蛋和臭豆腐。

一個80平米的小平房，在這三線小城市裡每個月500塊錢，不包括水電費。房東沒有賣房子的打算，純粹是想等着拆遷的時候有個不錯的補償條件。

一次意外的車禍，讓呂樹在被幾乎撞死的前提下，覺醒了星圖兌換系統。呂樹覺醒後，于是開始了修行之路，呂樹修行的功法并不像其他同學那樣需要依靠天地靈氣，隻需要不斷的取得别人的負面情緒值，這項技能令主角徹底告别了好好說話。呂小魚的修行功法是操控魂魄，修煉比呂樹更加簡單，睡着覺就可以修煉了。兩個人相依為命，共同修行。

由于靈氣複蘇，世界上各大遺迹相繼開放，呂樹獲得了大量的金錢，以及覺醒很多技能，并且随着升級得到了飛劍伴生器物——屍狗（重力量的飛劍）、伏矢（重速度的飛劍）、雀陰（重數量的飛劍）、吞賊（烈焰大劍，近戰）、非毒（扭頭葫蘆）、除穢（心劫焰，執掌心劫）、臭肺，分别對應七魄，主掌喜、怒、哀、懼、愛、惡、欲。

并在随後得到了各種神器。比如，山河印，是北邙遺迹陣眼，可調動洛城範圍一切天地靈氣，能通過消耗星辰之力擴大控制範圍，并附儲物空間。變臉面具，則是象島遺迹陣眼，戴上後可變幻成其他人的模樣，但不能改變身高體型。

扭頭葫蘆是呂樹幼年遺失的法器，後來重新從李典手中購回。紫金葫蘆，可通過呼喚對方真名強行讓其頭部朝向自己，并且能對抗天劫。還有日鏡，日月山下獲得的道具，能發出非常強烈的光線，造成對方視覺障礙。以及黑珠，六大家族争奪洛城黑市時贈送給呂樹的黑色寶珠，可以将人傳送至混沌深淵。最後還有承影劍，是聶廷、石學晉贈送的上古神器，劍體透明，内有劍靈海公子（敖海）。

另外，得到了得力寵物，混沌黑龍，原為金色神水器靈金色小蛇，吞噬混沌黑霧後變成黑色，吞噬祭龍台後化龍，其龍吟聲為“嘤嘤嘤”。非常厲害，幾乎是扭轉乾坤的存在。

而呂小魚也在探索各大遺迹，從遺迹中得到了一些好處，修煉也日漸有所精進。得到了三大魂魄，類似于八奇技之一拘靈遣将，首先是安東尼·史密斯，他是土系異能強者，技能沙瀑天葬，鹽湖遺迹中與陳百裡交手受傷，後被呂樹打至瀕死逃跑，半路上遇到呂小魚被補刀緻死，死後魂魄被呂小魚所拘。吸收了呂宙大宗師陳钰璇的法則後，晉升為大宗師。第二個是，賈桑伊，他是一個具現系異能強者，能具現飛劍，萬劍朝宗堪稱絕技，在芭提雅被李一笑殺死，死後魂魄被呂小魚所拘。吸收了呂宙大宗師薛聖佑的法則後，晉升為大宗師。第三個是卡米洛·博爾蓋索，他曾是信仰理論部主教，技能非常強大，會做飯，老虎背要塞一戰中被聶廷斬殺，死後魂魄被呂小魚所拘。吸收了遺迹大宗師銅桓宗宗主的法則後，晉升為大宗師。另外，也有三大寵物随身，第一個，就是小兇許，這是呂樹從北邙遺迹中帶出來的靈獸松鼠，經不斷以洗髓果喂養後實力直線提升，後來獲得“造夢”能力，麾下統領有洛城地帶的數萬進化老鼠大軍，上天入地，偵查武裝，無所不能。晉升一品後獲得說話能力，但帶着奇怪的口音。第二個寵物皮皮豬，則是呂小魚從鹽湖遺迹中帶出來的靈獸野豬。還有第三個大喵，也是呂小魚從鹽湖遺迹中帶出來的靈獸山貓。

這之中呂樹和呂小魚加入了天羅地網這個組織，在這個組織中感受到了溫暖，呂樹從一個隻想守護呂小魚的人，變成了一個願意守護整個國家的天羅，不再孤獨，有了歸屬感。

天羅地網組織有十三天羅，第一天羅聶廷，神藏境，初登場為二品，東方第一高手，綽号“新亭侯”。刀法無雙并且覺醒腦力異能，可同時提取上千監控視頻信息，為人冷靜理智卻極為護短，是地球上第一位突破到神藏鏡的高手。第二天羅石學晉，在天羅地網裡的地位僅次于聶廷。他與聶廷從小一起長大，父親是聶廷的師傅。自身無修行資質，一生最愛看書，立志貫通三教為天下無資質的普通人走出一條新的修行道路。最終成功創出了可無視修行資質修煉的法門，并且厚積薄發，四步晉入神藏境。在最終大戰時用生命複活了成巧秋等人，疑似跨入了神王境，在番外時被呂樹用鳳凰蛋複活。第三天羅一品陳百裡，陳祖安的二爺爺。性情暴躁，為了修清靜無為而出家當了道士，号稱啥時候把脾氣養好了才會還俗。很反感别人在自己面前說外語，尤其是中英文混搭，主張用中文表示修為和資質等級。看中了呂小魚的資質，欲收其為徒遭拒。第四天羅李一笑，曾為江湖人士，後被天羅地網招安。修外家功夫，血高防厚，攻擊力相對一般。為了調查未知的三品高手（呂樹）被派往洛城外國語學校擔任校長。為人直率、膽大心細，但辦事很不靠譜，經常放飛自我，屢次被聶廷派去海外遺迹坑人。覺得天羅工資太低，一門心思想要掙錢，卻沒有絲毫斂财能力，看中了呂樹的生意頭腦，與其合作卻因種種意外一分錢都沒有撈着，似與金錢絕緣。與納蘭雀相愛相殺，曾多次被呂樹兄妹發現私房錢，被納蘭雀收走。

第十二天羅是卡洛兒·奧丁·約翰遜，神藏境，初登場為四品，北歐神族組織成員，在遺迹中與呂樹相遇後愛上了他，後因聽聞呂樹被神集殺害的消息而覺醒奧丁血脈，一舉被奉為北歐神族的“衆神之主”。為了複仇單槍匹馬進攻神集，覆滅了神集的大半戰力，但也因此導緻永恒之槍受損，身體留下了隐患。後來在撒丁島和呂樹舉行了一場“世紀婚禮”，呂樹為了救她将世界樹植入其體内，從那之後呂樹手上便一直戴着一枚“易拉罐”的拉環作為戒指。事後卡洛兒失去了記憶，但卻又重新對呂樹一見鐘情，為了追求對方而主動轉學到洛神修行學院。老虎背要塞一戰後記憶恢複，獨自住在世界樹旁等待呂樹的歸來。黃石公園遺迹開啟後兩人再次重逢，遺迹事件結束後，她向聶廷申請成為第十二天羅，并随呂樹一同前往呂宙。真實身份為上一世暗圖擁有者呂洛兒轉世。

天羅地網外籍人員櫻井彌生子，一品修為，初登場為三品，天才劍道少女，日本神集組織保守派織田拓真的弟子。曾奉命以拉攏為目的接近呂樹假扮的桐原洋介，結果卻在不知不覺中愛上了呂樹，得知呂樹的真實身份後協助其逃脫神集的追殺。神集遭受重創後櫻井彌生子整合了保守派和主戰派的勢力，成為了神集新一任領袖。錢包裡永遠裝着當初呂樹付給她的十幾萬日元工資，心中期待着與呂樹的重逢。奴隸主事件中兩人再次發生交集，期間她和呂樹、文在否、禦扶搖一起經曆了一段難忘的旅行，後來禦扶搖派出殺手意圖殺死她，被呂樹所救。為了和呂樹在一起，她主動向聶廷和石學晉提出想要加入天羅地網，并成為了天羅地網的外籍成員。

第七天羅陳祖安，一品，初登場為四品，洛神修行學院物種研究專業學員，京都世家陳家子弟。身材肥胖，鹽湖遺迹一事中與呂樹結識，雖然資質隻有乙級但卻與甲級天才們一起參加集訓。對呂樹十分佩服，稱呼其為“樹兄”。其覺醒的異能可以讓他一頓吃下十五天份量的糧食并儲存在體内，并且其能力還表現出了一些“吞噬能量”的特性。在龍門山上與黑羽軍的戰鬥中突破，成為了一品高手，異能進化成能夠儲存一百五十天份量的食物，其胃為獨立空間，可以将敵人的攻擊吸入自己體内，他将這種能力命名為“吞天”。由于第六天羅風夜明和第七天羅風雲鹿卸任天羅職位，他和成秋巧補位成為了天羅。

第八天羅成秋巧，一品，初登場為四品，最終一戰中死前跨入神藏境，洛神修行學院物種研究專業學員，豫州甲級資質天才。皮膚黝黑，和呂樹在甲級天才集訓中結識，見識到呂樹的能耐後便對其佩服得五體投地，從此稱呼其為“樹哥”。在呂樹幫助下覺醒異能，能通過唱歌施展禁空領域。在龍門要塞與黑羽軍作戰時晉升為一品，其異能進化為通過念詩來施展禁空甚至湮滅能力。經曆黃石公園遺迹後他和陳祖安替補風夜明和風雲鹿成為了天羅。在呂樹大戰神王惡念時，燃燒自己的一切，跨入神藏境，以一首，千山鳥飛絕，萬徑人蹤滅，湮滅王城萬徑血妖，後化為飛灰，在大結局被石媽媽用生命複活。

還有就是傀儡師組織裡的背叛者擇夢，化為神樹的滅絕，以及隐藏的曹青辭，神藏境，初登場為五品，洛神修行學院物種研究專業學員，與呂樹同樣出身于洛城外國語學校。很有氣質的女生，平時沉默寡言，洛城道元班唯一一個甲級資質天才，其天賦在全國所有甲級天才中也屬于首屈一指。覺醒時間異能，拜聶廷為師，盡得刀法真傳。一心隻在修行上，但很關心呂樹，對于呂樹的話幾乎言聽計從，甚至極少對呂樹産生負面情緒值 ，後來坦言自己在這世上隻信任呂樹一人。真實身份為傀儡師淚訣轉世。

在保護長白山的戰役中，呂樹被背叛傀儡師擇夢擄走，回到了呂宙，一個和地球平行的時空，在那裡尋找重返地球的通道。過程中先做了土匪，主要目的是脫貧緻富，因為呂宙缺肥皂，于是，發明肥皂，準備做成跨國連鎖壟斷公司，認識了侍衛56人之一的張衛雨，酷似李逵的李黑，後成為武衛軍統領，原因是前任統領死了，準備脫離隊伍，結果發現，組建隊伍更容易得到負面情緒，來進行升級，于是把這支軍隊訓練成一支精兵強将。在地球與呂宙空間通道開啟時，西方天帝侵略地球之際，随即呂樹帶領武衛軍回到地球，也幫助地球解決掉了入侵的呂宙大壞蛋黑羽軍軍團。

并且在回到地球後，在最後一次遺迹中，呂樹也得知自己的身份，轉世前自己為老神王。但是呂樹拒絕了接受前世回憶，這一世就是這一世，也知道了呂小魚本為劍廬主人，為了自己放棄了劍道，用劍以及心血締結了合約，成為暗圖，隻願陪伴自己，幫助這一世的自己殺自己不願意殺之人，讓自己不再有惡念，不在掉入深淵。

後空間通道再次開啟之時，呂樹等人重返呂宙，殺該殺之人，也解決掉了地球的隐患。空間通道完全開放後宇宙與地球合二為一時，呂樹并沒有做回老神王，而是回到了與呂小魚的地球的家，将天帝之位給了文在否，安心地做自己的第九天羅。故事，也講完了。