西遊記後傳，孫悟空成為新的萬佛之祖，那燃燈古佛去了哪裡。

無天占領三界後，折騰三十三年。不僅通過阿修羅界的作坊，仿制出了玉帝和天界衆神，派往天庭。就連佛界衆聖也統統被仿制，悟空在靈山所見到的佛界衆聖都是冒牌貨。就連悟空的火眼金睛也沒有識别出，可見無天的手段之高，法力之強。

如來圓寂時，也對衆聖說過，“厄運已至，此乃劫數和定數，非我等法力能與此魔相抗衡”。并用一首佛偈，來安慰大家不要怕，不要輕舉妄動。因為有一個人，可以解決這場浩劫。就是後來被三藏參悟佛偈時說出的孫悟空，孫悟空可以解決無天帶來的這場浩劫。

燃燈古佛也說過，這場浩劫，非比尋常。而且作為萬佛之祖，燃燈古佛是先于如來佛祖圓寂。對于三藏來說，燃燈古佛怎會無端涅槃，三藏也是一頭霧水。這裡說明一點，圓寂或者說涅槃不是意味着死了。

另外，其實無天早在黑暗之淵時，就早已籠絡了九頭蟲和牛魔王等一衆妖魔。他還派牛魔王去尋找舍利子，所以那時無天就知道十七顆舍利的存在，和對他的威脅。牛魔王在隐霧山洞中找到了一顆舍利，卻被已經圓寂的上古萬佛之祖，龍光古佛的真靈封閉洞口，困死在洞中。這也是悟空來到後，發現洞中有一對牛角，正是被困死的牛魔王。

雖然，在無天占領三界後，燃燈古佛早已圓寂。但燃燈古佛在圓寂前，早已把全部舍利的位置和悟空是無骨舍利的事，告訴了悟空曾結拜為兄弟的鎮元子，并對鎮元子說這事隻能告訴悟空一人。所以鎮元子也沒有辜負燃燈古佛所托，在被假觀音騙到南海後，當假觀音問起舍利的事。鎮元子也隻是避而不談，最後把舍利的藏匿之處全部告訴了悟空。

而且，燃燈古佛的真靈告訴悟空，從上古到他一共十七顆萬佛之祖的舍利，要悟空統統找到。而鎮元子也沒有告訴悟空就是那顆無骨舍利，說到了時候無骨舍利自然會出現。

到了如來重返佛界的關鍵時刻，接近子時，悟空和無天的法力都發揮到最大時，鎮元子說出了悟空是那顆無骨舍利，除了無天很意外，連悟空也很意外。這說明悟空之前已經圓寂過一次，否則他怎麼會是無骨舍利呢。無骨舍利能夠重生為孫悟空，孫悟空為了消滅無天又圓寂，化為無骨舍利消滅了無天。

最後有奇迹般的回來，被如來佛祖封為新的萬佛之祖。那燃燈古佛圓寂後，為什麼沒有出現在天界。而且他又是如來的老師，悟空都能圓寂兩次再回來。燃燈古佛圓寂，為什麼沒有回來，去哪了。其實燃燈古佛這萬佛之祖的地位，也是到了該傳給新人的時候。因為上古已經有十五位萬佛之祖圓寂，而燃燈古佛讓位後，他的真靈回到了真性佛土。

随後換了一個身份，在别的世界度化衆生。因為宇宙無限大，需要度化的衆生也是無量無邊。就像觀世音菩薩，很久前早已成佛，佛号正法明如來。現在以觀世音菩薩的身份，在西方極樂世界幫助阿彌陀佛，接引念佛往生的衆生。

所以，燃燈古佛看似圓寂了，實則是真靈回到了真性佛土，這個地方隻有佛與佛才能證悟到的境界。