使用場合不同、記憶功能不同、工作原理不同、結構不同。
1、使用場合不同：增量型編碼器比較通用，适用于大部分場合。絕對型編碼器有量程範圍，适合用在一些特殊機床上。
2、記憶功能不同：增量編碼器有一個缺點，即當發生電源故障時丢失軸位置。然而對于絕對編碼器來說，即使發生電源故障也不丢失軸位置。絕對編碼器由機械位置确定編碼，它無需記憶，無需找參考點，而且不用一直計數，什麼時候需要知道位置，什麼時候就去讀取它的位置。
3、工作原理不同：絕對編碼器絕對編碼器光碼盤上有許多道光通道刻線，每道刻線依次以2線、4線、8線、16線編排，在編碼器的每一個位置，通過讀取每道刻線的通、暗，獲得一組從2的零次方到2的n-1次方的唯一的2進制編碼（格雷碼）。增量型編碼器是直接利用光電轉換原理輸出三組方波脈沖A、B和Z相；AB兩組脈沖相位相差90°，從而可以方便地判斷出旋轉方向，而Z相每轉一個脈沖，用于基準點定位。
4、結構不同：增量型編碼器由一個中心有軸的光電碼盤，有光電發射和接收器件讀取，獲得四組正弦波信号組合成A、B、C、D,每個正弦波相差90度相位差，将C、D信号反向，疊加在A、B兩相上，可增強穩定信号；另每轉輸出一個Z相脈沖以代表零位參考位。絕對編碼器光碼盤上有許多道光通道刻線。
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