政治上：元朝設行省給了宰相很大權力，後期甚至左右皇位繼承； 清朝中央集權高度集中，君主專制達到巅峰，革除了議政王大臣會議，各機構實權都歸于皇帝。
經濟上：元朝更重視放牧，清朝重視農耕，蒙古對商業并不是很抑制，商品經濟得到了發展；清朝重農抑商嚴重，雖重視農業，但阻礙了社會進步。
文化上：元朝更傾向于自己的文化，對漢族文化很排斥，甚至皇帝都沒幾個會說漢語的；還把人種劃分等級。而清朝基本就是被漢文化同化了，對漢文化十分推崇，學習。
科技上：元朝科技進步高，軍事科技水平也有很明顯進步，生活方面也有。到清朝，由于文字獄等原因科技進步上明顯慢了許多。
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