有以下10所大學：
1、南通大學：規模結構合理、學科門類齊全、教學質量優秀、辦學效益明顯的地方綜合性大學。
2、南通高等師範學院：我國第一所獨立設置的中等師範學校。
3、南通紡織職業技術學院：我國第一所紡織專科學校。
4、南通職業大學：全國辦學曆史最長的高等職業院校之一。
5、紫琅職業技術學院：具有頒發高等教育學曆文憑資格的全日制民辦普通高校，也是南通市第一所民辦高校。
6、南通開放大學：以現代信息技術為支撐，面向全體社會成員，服務全民終身學習的新型高等學校。
7、南通航運職業技術學院：全日制普通高等學校。
8、南通農業職業技術學院：公辦全日制普通高校。
9、南通市商業職業技術學校：以舉辦五年制高職為主的專科層次的全日制普通高等職業學校。
10、江蘇聯合職業技術學院南通商貿分院：以五年制高職教育為主的專科層次的全日制普通高等職業學校。
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