巫姓主要有三大起源，一是源自上古醫藥始祖，黃帝時期有一位宰相叫做巫彭，他非常精通醫術，被奉為醫神，子孫就傳承了巫姓。二是源自魯國貴族叔肸，叔肸的曾孫叫做公巫召伯，他的子孫以祖先号為姓。三是源自官職名，商朝設有官位叫做“巫鹹”，子孫以祖先官為姓。
1、源自巫彭
巫姓最早可以追溯到上古時期，黃帝手下有一位非常善于施行草藥醫術的宰相，他就叫做巫彭，根據《姓氏考略》記載可知，巫彭首創了中草藥，他使用動物喂食草藥治病救人，甚至被軒轅氏奉為醫神，後來還被黃帝封為醫相，而他的子孫也就以祖先名号為姓了，從而形成了巫姓氏族。
2、源自叔肸
巫姓還有另一個姓氏則源自魯國魯文公的兒子叔肸，叔肸的曾孫就叫做公巫召伯，伯是指一個爵位，而公巫則是他的姓，最終公巫召伯的子孫也就跟随着祖先以“公巫氏”為姓，後來便簡化為巫姓或者召姓等，從而傳承至今。
3、源自官職名
巫姓還有部分族人則源自官職名，在商朝時期，設置了一種專門掌管占蔔的官職叫做巫祝，這都是源自一位叫做巫鹹的商朝大臣，他是非常初名的占星師，就是他發明了現在的鼓，并且也是首次使用筮占蔔的人，而“巫”本身就是指召威神靈的職業，從而官吏“巫祝”的後人也就以祖先的官為姓了，形成了巫臣氏，後來簡化為巫姓。
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