部分品種的鳄魚是保護動物。鳄魚有很多種種類，并不是所有的都是保護動物，一般數量較少瀕臨滅絕的則我保護動物。揚子鳄、中美短吻鳄、南美短吻鳄、窄吻鳄、尖吻鳄、中介鳄、菲律賓鳄、佩滕鳄，尼羅鳄、恒河鳄、灣鳄、菱斑鳄、暹羅鳄、短吻鳄、馬來鳄、食魚鳄等屬于瀕危野生動植物種，是國際性重要保護物種，被《華盛頓公約》CITES列入附錄I名單，禁止其國際貿易。另外，爬行綱鳄目除列入附錄I的以外所有物種均被列入CITES附錄II名單，管制國際貿易。
鳄魚為肉食性卵生脊椎類爬行動物，是兩億多年前與恐龍同時代的最古老爬行動物，也是迄今生存着的最原始動物之一。 鳄魚因強盛的生命力而生存和繁衍，成為地球上最古老的生物“活化石”之一。鳄魚屬于瀕危野生保護動物，被國際上列為 I 類保護的瀕危野生動植物。我國特産的揚子鳄 （亦稱中華鳄 Alligator sinensis）被列為國家一級野生保護動物。2003 年國家林業局批準了尼羅鳄（Crocodylus niloticus）、灣鳄 （C. porosus）和暹羅鳄 （俗稱泰國鳄，C. siamensis）等 3 種鳄魚列入首批 54 種可商業利用的野生動物。
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