增值稅稅率不同 2019年起一般納稅人的增值稅稅率有4檔：13%、9%、6%、0；小規模納稅人增值稅沒有稅率，隻有一個征收率3%，特殊行業是5%。
計稅方式不同 一般納稅人增值稅抵扣計算=銷項稅額-進項稅額-減免稅額=應納增值稅；小規模納稅人增值稅直接計算=收入*征收率3%。
使用發票不同 一般納稅人可以自行開具增值稅專用發票和增值稅普通發票，也可以開具4檔稅率的增值稅發票，同時收票方也能抵扣13%-6%的進項稅額；小規模納稅人隻能自行開具增值稅普通發票，收票方不能抵扣進項稅額；小規模需要開具專用發票時，需要去稅局才能開具，隻能開具3%的專票。
稅收優惠不同 一般納稅人在增值稅方面一般很少有優惠征策；2019年起小規模納稅人在增值稅方面可以享受：季度收入30萬以免交增值稅的優惠征策，同時附加稅減半征收入的征策。
認定方式不同 新成立的企業，如果沒有去選擇申請一般納稅人，就自動認定為小規模納稅人；一般納稅人需要去申請才能認定，認定方式有兩種：一是有固定辦公場所，可以去申請認定，别外一種是銷售額超過了500萬，也可能去申請認定。
申報方式不同 一般納稅人都是按月申報，并且增值稅要在特定的系統内才能申報；小規模納稅人可以選擇按月申報，也可以選擇按季申報，增值稅不需要特定的系統就可以完成申報工作了。
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