1、祛痰開竅：石菖蒲可以化濕濁，它的氣味芳香，也具有竅祛痰濕的功效，适用于清陽不升而引起的神識不清、耳聾目昏和精神遲鈍等症狀。
2、安神定志：石菖蒲對人體的中樞神經有抑制作用，因此它可以起到鎮靜安神的作用，對失眠的症狀也有緩解作用，是解郁安神的一劑良藥。臨床上對于精神病患者有鎮靜和催眠的作用。
3、醒脾開胃：石菖蒲裡面的揮發油氣味芳香，可以促進消化頁分泌，抑制異常發酵，因此，它具有醒脾、胃助運化，用适合于治濕困脾胃的症狀。
4、解痙治痛：石菖蒲的味辛、微溫，它能夠緩解腸管平滑肌痙攣、醒稗和胃，具有鎮靜的作用，故能用冶腹痛症。對于急慢性胃炎、胃神經官能症、胃及十二指腸潰瘍等所緻的腹痛，有很好的和中辟濁、醒脾開胃、理氣止痛的作用。
5、芳香辟濁：石菖蒲的氣味芳香，能辟穢化濁，具有解毒驅邪、芳香辟濁、解毒驅邪的功效，是古人預防疾病的常用藥。古人用它來預防瘟疫，現在一些老人也會用此方法來預防疾病。
6、活血、緩解關節疼痛：石菖蒲能理氣活血、祛風宣濕，适用于風濕痹阻、關節腫痛、跌打損傷之瘀腫疼痛等症狀，可以消腫止痛，對于關節疼的人，将石菖蒲搗爛加适量的白酒，放炒鍋家人，敷在患處效果很好。
7、消化系統：石菖蒲能促進消化液的分泌、制止胃腸異常發酵，并有緩解腸管平滑肌痙攣的作用。它裡面含有的細辛醚能對抗氯化鋇引起的離體腸管的興奮作用。
8、消炎抗菌：石菖度在皮膚病上也有很好的效果，對各種癬菌有着不同程度的作用，用菖蒲水浸劑1：3的比例使用，對皮膚癬菌有好的消炎抗菌作用。
9、心血管系統：石菖蒲揮發油(β-細辛醚)在一定濃度下有使豚鼠冠狀血管擴張的作用。臨床常用于冠心病、肺心病等屬于痰濁氣滞之胸痹者的治療，其機制可能與其能增加冠脈流量有關，還可能與鎮靜、改善消化機能、平喘、鎮咳等作用有關。
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