南澳屬大鵬新區管轄。大鵬新區是深圳市的一個功能新區,位于深圳東南部,三面環海,東臨大亞灣,與惠州接壤,西抱大鵬灣,遙望香港新界。深圳市最東部大鵬半島最南端,位于龍崗區東北,東臨大亞灣,西臨大鵬灣,北與大鵬辦事處接壤,三面環海,海岸線長達65公裡,與香港隔海相望,距香港東平洲島最短距離僅2海裡。轄區陸域面積約115.06平方公裡,下轄9個社區居委會,共45個居民小組,總人口約20930人,其中戶籍人口7601人,流動人口13329人。南澳半島腹地開闊,屬于低山丘陵地區。地勢東部高、西部低,中部以七娘山東部為邊界,整體平均地勢較低,從東到西呈馬鞍形起伏。南澳轄區山林面積100.01平方公裡,森林覆蓋率達到87%。