同源異型基因是生物體中一類專門調控生物形體的基因,一但這些基因發生突變,就會使身體的一部分變形。同源異型基因屬于同源框家族的其中一員,在大多數同源異型基因中,會含有一段約180個核苷酸的同源異型盒,可以轉錄出含有約60個氨基酸序列,稱為同源異形域。同源異型基因的特色之一,是其排列順序與其作用順序、作用位置相關。同源異型盒基因廣泛存在于真核生物中,其結構中含有一個高度保守的同源異型盒,編碼一類轉錄調控因子;同源異型盒蛋白,并通過同源異型盒蛋白在生物的個體發育和細胞分化中起調控作用,同源異型盒基因與同源異型基因具有明顯的差異。