1、品種不同。小米椒是屬于朝天椒的一種，所以朝天生長的一類辣椒都可以稱為朝天椒，其外形和顔色都類似。小米椒是一種屬于茄科植物的辣椒，原産南美洲，後來引入我國，在貴州、雲南等地區都有大量種植。
2、外形不同。朝天椒的植株高度為30厘米—60厘米，個頭大小比較适中，顔色呈鮮紅色，并且表面光滑有光澤，椒形整齊美觀。小米椒是低矮的灌木，最高可以長到2米高，但是小米椒的個頭比一般朝天椒都要小，外形和顔色相似。
3、味道不同。朝天椒屬于辣椒中的變種，味道普遍是比較辣的，一般用來制作醬料或者腌制鹹菜時用得比較多，吃火鍋時也會見到很多朝天椒。小米椒的辣度在朝天椒中又是比較低的，并且有濃濃的香味，一般在烹炒的時候可以将小米椒剁碎後爆香使用。
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