生物工程專業主要涉及生物化學、分子生物學、生物物理學、結構生物學和細胞發育生物學等學科領域。生物技術專業主要包括生物芯片技術、微生物發酵工程、藻類技術、細胞工程及酶工程和生态環境工程。
随着微生物學、免疫學和分子生物及其他學科的發展，研究生物工程已改變了傳統概念。對微生物結構、生長繁殖、傳染基因等，也從分子水平去分析，現已能識别蛋白質中的抗原決定簇，并可分離提取，進而可人工合成多肽疫苗。
對微生物的遺傳基因已有了進一步認識，可以用人工方法進行基因重組，将所需抗原基因重組到無害而易于培養的微生物中，改造其遺傳特征，在培養過程中産生所需的抗原，這就是所謂基因工程，由此可研制一些新的疫苗。
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