1、次級鍵secondary bond:除了典型的強化學鍵(共價鍵、離子鍵和金屬鍵)等 ,依靠氫鍵以及弱的共價鍵和範德華作用力(即分子間作用力)相結合的各種分子内和分子間作用力的總稱。
2、疏水鍵。疏水鍵是多肽鍊上的某些氨基酸的疏水基團或疏水側鍊（非極性側鍊），由于避開水而造成相互接近、粘附聚集在一起。它在維持蛋白質三級結構方面占有突出地位。
3、離子鍵。指陰離子，陽離子間通過靜電作用形成的化學鍵。離子鍵屬于化學鍵，大多數的鹽，由堿金屬或堿土金屬形成的鍵，活潑金屬氧化物都有離子鍵。含有離子鍵的化合物稱為離子化合物。離子鍵與物體的熔沸點和硬度有關。
4、氫鍵 。氫原子與電負性大的原子X以共價鍵結合，若與電負性大、半徑小的原子Y接近，在X與Y之間以氫為媒介，生成X-H…Y形式的一種特殊的分子間或分子内相互作用，稱為氫鍵。
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