批示和指示在含義方面、使用者方面、嚴重程度方面皆有區别。
首先，在兩者的含義方面，“指示”指的是對某件事情做出指定的表示，比較婉轉，可以是口頭上的指示，也可以是書面上的指示。而“批示”的指的是批改表述，語氣較嚴重，一般用于書面上較多。
其次，在使用者方面，“指示”可以用于長輩和較低級的領導級别，例如導師等。語氣婉轉，注重于對被指示者作出指導。而“批示”的語氣較嚴厲，一般是較高級的領導階層做出不可更改的命令時使用。
最後，在嚴重程度上，“指示”一詞帶有可以商量的意思，在執行某種政策時是一種大緻的方向，是可以進行略微的修改的。而“批示”一詞代表一種絕對的威嚴，不容改變的意思，有一種批評改正的意思，代表事件已經到了比較嚴重的程度。
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