1、發明人攜帶申請登記表、申報知識産權保護申請表、保密審查證明、減緩證明表、交底材料前往先進技術研究院審查備案。
2、材料通過審查，發明人前往專利中心或代理機構專利中心進行專利申請，繳存費用。
3、專利代理人與發明人聯系，商讨确定要求保護的技術範圍、修改專利申請文件并定稿；代理機構向國防專利局遞交專利申請并取得專利申請号。
4、專利授權後，代理機構通知發明人領取受理通知書、授權書和證書原件。由于國防專利需要保密，然而保密并不意味着所有人都不知道，保密是限于一定範圍，隻限一定人知悉。國防專利機構會出版《國防專利内部通報》，這屬于國家秘密文件，其知悉範圍由國防專利機構确定。
5、發明人将專利證書原件上交先進技術研究院，由先進技術研究院上報學校統一存檔，專利申請費及授權當年的年費由科發院或企業與代理機構結算。
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