商住兩用房買後是每年要交稅的。根據《中華人民共和國房産稅暫行條例》規定，商住房的産權人應該在每年4月份前向房屋所在地地稅部門申報繳納房産稅，房産稅實行的是比例稅率，以房産原值(評估值)為計稅依據，稅率為1.2%，房産稅年應納稅額=房産原值×(1-30%)×1.2%或稅務機關評估值×1.2%。
對于房産稅，個人普通非營業住房是不用交房産稅的，如果是商業使用的，則要交房産稅。房産稅自1986年10月1日開始征收。對商業和寫字樓以房産原值減除30%後的餘值為稅基，1.2%的稅率，對住宅類免征。商住兩用本質上是商業，所以有征稅依據。
商住兩用房出租時需要繳納的稅費：營業稅：租金收入×5%城建稅：營業稅額×7％教育費附加：營業稅額×3％堤圍費：租金×0.18%房産稅：租金×12％印花稅：每份合同需按租賃金額的0.05%貼花個人所得稅：(租金-稅費-維修費800-法定扣除額800)×20％。
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