九寨溝海拔3000米。九寨溝自然保護區地勢南高北低,山谷深切,高差懸殊,區北緣九寨溝口海拔僅2000米,中部峰嶺均在4000米以上,南緣達4500米以上,主溝長30多公裡。峰頂和兩側山峰基本終年積雪。
九寨溝地處青藏高原向四川盆地過渡地帶,地質背景複雜,碳酸鹽分布廣泛,褶皺斷裂發育,新構造運動強烈,地殼擡升幅度大,多種營力交錯複合,造就了多種多樣的地貌,發育了大規模喀斯特作用的鈣華沉積,以植物喀斯特鈣華沉積為主導,形成九寨溝豔麗典雅的群湖,奔瀉湍急的溪流,飛珠濺玉的瀑群,古穆幽深的林莽,連綿起伏的雪峰。