1、外形和口感不同。甜荞麥的顆粒呈現三棱”角狀非常明顯，吃起來沒有苦味；苦荞麥的顆粒呈現三棱”圓潤狀，吃起來略帶苦苦的味道。
2、營養不同。苦荞所含的生物類黃酮如蘆丁（維生素P）和煙酸（維生素PP）為甜荞的13、5倍，而燕麥、小麥、大米等禾本科植物不含維生素P，膳食纖維、蛋白質、維生素B2分别為甜荞的1、6倍、1、65倍、3、16倍。
3、功效不同。苦荞麥茶含蘆丁，可軟化血管，具有降血脂、降血糖、降血壓，減肥敗毒、清理人體垃圾、激活胰島素分泌等功效，苦荞麥茶富含蛋白質礦物元素和人體必須的9種脂肪酸、亞油酸等生物活性物質，可健脾開胃、通便潤腸、美容養顔、醒腦提神、防失眠、抗衰老、抗氧化、平衡人體機能，具有神奇的養肝、護肝和解酒功能；甜荞麥的莖葉有降壓，止血的功效，适用于高血壓，毛細血管脆弱性出血，防止中風，視網膜出血，肺出血。甜荞麥的種子有健胃，收斂的功效，用于止虛汗。可以炒香研末，外用收斂止汗，消炎。
4、用途不同。苦荞麥和甜荞麥可以作為食物使用，例如人們熟悉的荞麥茶，做荞麥茶無疑是大多做成苦荞茶的五谷之王”苦荞麥更好；荞麥殼可以用來做枕頭，做枕頭的話苦荞麥和甜荞麥兩者的含量相差不多，都是很高的了，已經超出正常使用需求，但苦荞的透氣性要差好多，也硬好多，稍帶味道不如甜荞，這也是苦荞麥殼要比甜荞便宜好多的原因。
5、适用人群不同。苦荞麥是老弱婦孺皆宜的飲食。由于苦荞麥含有豐富的維生素E和可溶性膳食纖維，同時還含有煙酸和蘆丁（芸香甙），蘆丁有降低人體血脂和膽固醇、軟化血管、保護視力和預防腦血管出血的作用，所以對于糖尿病人更為适宜，特别适宜食欲不振、飲食不香、腸胃積滞、慢性洩瀉、出黃汗之人和夏季痧症者食用；甜荞麥的莖葉有降壓，止血的功效，适用于高血壓，毛細血管脆弱性出血，防止中風，視網膜出血，肺出血，此類病患者可以多食用。
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