1、學習方式不同。在職研究生通常是在周六和周日上課學習。全日制研究生從星期一到星期五上課。
2、報考方式不同。在職研究生報考方式主要有兩種方式:同等學力申碩和非全日制研究生。同等學力申碩，先入學後考試。符合資格的學生可先參加在職訓練班，然後參加申碩考試。非全日制研究生，入學前考試後。需參加12月聯考和學校複試，成績優秀的學生可以進入他們喜歡的大學。全日制研究生和非全日制研究生的報考過程是相同的。
3、證書不同。在職研究生取得的碩士學位證書與全日制研究生取得的碩士學位證書相同。但在職研究生學曆與全日制将有區别，其學曆将标會注明為“非全日制”，全日制研究生學曆将标記為“全日制”将有所區别。但是，國家政策明确規定，“其學曆學位證書具有同等法律地位和相同效力”，在職研究生證書的含金量還是有較高的價值。
4、面對人群不同。在職研究生主要面對的是工作多年的在職人員。全日制研究生主要面對的還是本科應屆生，但兩者都被國家認定為研究生教育形式。
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