蛋白質的二級結構主要有：
1、纖維蛋白（fibrousprotein）：一類主要的不溶于水的蛋白質，通常都含有呈現相同二級結構的多肽鍊許多纖維蛋白結合緊密，并為單個細胞或整個生物體提供機械強度，起着保護或結構上的作用。
2、角蛋白（keratin）：由處于α-螺旋或β-折疊構象的平行的多肽鍊組成不溶于水的起着保護或結構作用蛋白質。
3、膠原（蛋白）（collagen）：是動物結締組織最豐富的一種蛋白質，它是由原膠原蛋白分子組成。原膠原蛋白是一種具有右手超螺旋結構的蛋白。每個原膠原分子都是由3條特殊的左手螺旋（螺距0.95nm,每一圈含有3.3個殘基）的多肽鍊右手旋轉形成的。
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