1、本質不同。股本溢價是指股份有限公司溢價發行股票時實際收到的款項超過股票面值總額的數額。資本溢價是指企業在籌集資金的過程中，投資人的投入資本超過其注冊資金的數額。
2、所屬不同。股本股本溢價是資本公積一種，而資本公積是指投資者或者他人投入到企業、所有權歸屬于投資者，并且投入金額超過法定資本部分的資金。資本公積包括：資本（或股本）溢價、接受捐贈非現金資産準備、股權投資準備、撥款轉入、外币資本折算差額、關聯交易差價以及其他資本公積。資本溢價版是有限責任公司投資者交付的出資額大于按合同、協議所規定的出資比例計算的部分。
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