分子生物學基本知識?基因:産生一條多肽鍊或功能RNA所需的全部核苷酸序列,下面我們就來聊聊關于分子生物學基本知識?接下來我們就一起去了解一下吧!
分子生物學基本知識
基因:産生一條多肽鍊或功能RNA所需的全部核苷酸序列。
基因組:生物體有機體的單倍體細胞中的所有DNA,包括核中的染色體DNA和線粒體、葉綠體等亞細胞器中的DNA。
C值:通常是指一種生物單倍體基因組DNA的總量。
C值矛盾:生物基因組大小同生物在進化上所處地位的高低沒有關系
splicing gene:即真核生物的結構基因,是有若幹外顯子和内含子相間排列的序列組成的,也稱間隔基因或斷裂基因。
Exon(外顯子):DNA與成熟RNA間的對應區域即氨基酸的編碼區,非間隔區。
intron(内含子):DNA與成熟RNA間的非對應區域即氨基酸的非編碼區,間隔區。
DNA的呼吸現象:DNA複制原點處氫鍵迅速斷裂與再生,導緻兩條DNA鍊不斷解鍊與聚合形成瞬間的單泡狀結構的過程。
轉座元(transposon):DNA上可自主複制和位移的基本單元。
返座元(retroposon):由RNA介導轉座的轉座元件,在結構和複制上與反轉錄病毒(retrovirus)類似,隻是沒有病毒感染必須的env基因,它通過轉錄合成mRNA,再逆轉錄合成新的元件整合到基因組中完成轉座,每轉座1次拷貝數就會增加1份,因此它是目前所知高等植物中數量最大的一類可活動遺傳成分
nick translation(切刻平移):DNApolII具有3’向5’外切和5’向3’聚合活性,可切除岡崎片段的引物RNA,可通過加入同位素标記的dDTP作為DNA的标記。
Replisome(複制體):由多種蛋白質組成的複合體,組裝成複制叉去分解DNA。
DNA複制(DNA Replication):親代雙鍊DNA分子在DNA聚合酶的作用下,分别以各單鍊DNA分子為模闆,聚合與自身堿基互補配對的遊離的dNPT,合成出兩條與親代DNA分子完全相同的子代DNA分子的過程。
基因敲除(gene knockout):進行功能基因的研究,通過用失活基因經同源重組取代細胞中正常的同源基因,研究被取代基因缺失後的表型可知其功能。
轉座子标簽(Transposon tagging):轉座元的插入可造成基因ORF的斷裂,使基因被插入失活,轉座元的插入如Tn使該DNA區域帶有标記基因可作為标簽尋找功能基因。
pseudogene(假基因):與正常基因結構相似,但喪失正常功能的DNA序列,往往存在于真核生物的多基因家族中。
klenow酶:指DNApolII經胰蛋白酶處理後的C-片段,其具有的3’向5’外切和5’向3’聚合活性。
trans splicing(反式剪接)分子之間的一種剪接方式:不同分子的exon相互連接形成新的分子——比較少見
Alternative splicing(可變剪接)50%的基因有這種剪接方式,剪接過程中選擇性的保留或去除hnRNA中的某些序列(可能是存在多個 polyA3添加位點、或存在多個promoter位點;也可能是exon或intron的選擇性保留)
Enhancer(增強子)真核生物中可提高鄰近啟動子利用率的順式作用序列,其功能不受位置(上遊或下遊)和距離的影響
終止子(terminator)終止子是為RNApol提供轉錄終止信号的一段DNA序列,需要經過轉錄後形成莖環結構起作用
啟動子(promoter)基因的一個組成部分,控制基因表達(轉錄)的起始時間和表達程度
S-Dsequence(S-D序列)是原核生物mRNA起始密碼子AUG上遊7~12Nt處存在一段rich(Pu)(AGGAGG)的區域,能被核糖體小亞基16srRNA識别并結合,可提高翻譯效率
readthrough(通讀)RNApol在終止子處不停止轉錄(ρ因子在RNApol停頓時無法及時趕上或其它抗終止因子的作用)的現象
gRNA(指導RNA)一類新的小分子RNA,可以和mRNA被剪輯的部分發生非常規的互補,G-U配對,對mRNA前體分子的編輯起了指導作用
RNA editing有些hnRNA剪接後不能立刻用于翻譯,還要進行某些堿基的添加、删除或替換
Ribozyme(核酶)此類RNA自我剪接所必需的小分子能切割mRNA分子,已被用于基因表達的阻遏---阻止病毒的複制;殺死癌細胞; 通過基因表達的阻遏發現新基因的功能
密碼子家族一
同工tRNA一種氨基酸可能有多個密碼子,為了識别也就有多個tRNA,幾個代表相同氨基酸的tRNA稱為同工tRNA
同義密碼 同一氨基酸的密碼子
錯義突變(missense mutation) : 核苷酸發生改變後其編碼的遺傳信息發生改變編碼其他的氨基酸
密碼子 mRNA上每3個核苷酸翻譯成蛋白質多肽鍊上的一個氨基酸,這3個核苷酸就成為密碼子
無義突變(nonsense mutation) : 核苷酸改變後變成無義密碼,導緻編碼框提前終止
同義突變(synpnymous mutation):核苷酸突變後其所在密碼子仍編碼同一個氨基酸(密碼子家族)
滲漏突變(leaky mutation) 蛋白質部分失活
S-D序列 原核mRNA5'端非翻譯前導序列一段,作為核糖體的識别和結合位點,5’-AGGAGG-3
Kozak序列 在真核細胞,有效的起始依賴于圍繞在起始密碼子ATG上下遊的一段叫Kozak序列的序列
ORF開放閱讀框即從起始密碼到終止密碼之間的連續的三聯體核苷酸序列
molecular chaperone(分子伴侶)是一類能協助初生多肽正确完成非共價折疊又不參與該蛋白質結構組成的蛋白質
多聚核糖體:在一個mRNA分子中結合一定數目的單位核糖體稱為多聚核糖體
蛋白質剪接蛋白質内含子的其DNA序列與蛋白質外顯子一起轉錄和翻譯,産生一條多肽鍊,然後從肽鍊中切除與内含子對應的a.a序列,再把與外顯子對應的氨基酸序列以肽鍵的形式連接起來,成為有功能的蛋白質
Intein(蛋白質内含子)一個蛋白質剪接元件,特點:①.切割位點保守②.具有自動切割加工能力③.具有核酸内切酶活性
extein (蛋白質外顯子)
1 cis-acting element(順式作用元件)
2 trans-acting factor (反式作用因子)
housekeeping gene(管家基因) 在一個生物個體的幾乎所有細胞中持續表達的基因,其産物能維持細胞的正常結構和功能。即組成性基因表達
luxury gene(奢侈基因) 隻在特定的細胞類型中表達的基因,賦予細胞特異性的功能。即誘導型表達
Gratuitous inducer這類小分子物質通常是operon編碼的酶的底物,可被降解,一些誘導物的結構類似物也能産生誘導效應,這類物質不能作為編碼産物的底物而被降解,稱為安慰誘導物
誘導物(inducer)是一種小分子引發了基因轉錄約束性的調節蛋白
操縱元(operon)是一個單位的細菌基因表達調控,包括結構基因和控制中的DNA分子所承認的調節基因産物
阻遏蛋白(repressor)一些operon被調節蛋白結合後表達受到阻遏,這類調節蛋白即repressor
Corepressor輔阻遏物小分子物質結合調節蛋白後導緻operon的表達受到阻遏,即可阻遏操縱元(repressible operon),這類小分子物質即Corepressor
癌基因(oncogene)表達或過量表達導緻細胞癌變(轉化),也稱為轉化基因(transforming gene)
抑癌基因(TSGs) 又名隐性癌基因,是一種抑制細胞生長和腫瘤形成的基因。在生物體内與癌基因功能相抵抗,共同保持生物體内正負信号相互作用的穩定
12 RNAi轉錄後基因沉默,即RNA幹擾
13基因印迹(gene imprinting)
肽核酸(PNA)是一類以多肽委骨架的核苷酸類似物,它獨特的結構決定了獨特的生化性質,具有很大的優越性,不帶電荷,雜交特異性強,能抵抗核酸酶及蛋白酶的水解
反義RNA( micRNA)
空轉反應 是指當核糖體A位點存在空載tRNA時産生pppGpp和ppGpp的現象
α-互補 載體帶有lacZ基因5’部分,它編碼β-半乳糖苷酶N-端的146個氨基酸,稱為α-肽,載體轉化的宿主細胞為lacZΔ15基因型,它表達β-半乳糖苷酶的C-端肽鍊,當載體與宿主細胞同時表達兩個片段時,宿主細胞才有β-半乳糖苷酶活性,使特異的底物X-gal 變為蘭色化合物,這就是所謂的α-互補
調控元(regulon):一個調節基因參與多個operon的調節(如SOS系統等)
本底組成型表達 某些操縱元即使被阻遏蛋白結合或無誘導蛋白存在時結構基因也出現低水平表達,這種低水平的表達也叫作本底組成型合成
基因座位控制區(LCR)能使基因在任何位置都表達,具有穩定染色質疏松結構的功能。它與相應的蛋白質因子相互作用可使染色質去組蛋白,保證複制時TF仍與啟動子結合
隔離子(insulator)能将染色體分割成互不影響的功能區域得順式元件,防止阻遏狀态或活化狀态染色質結構域向兩端擴展
RFLP(限制性内切酶片段長度多态性) RFLP标記是發展最早的DNA标記技術,指基因型之間限制性片段長度的差異,這種差異是由限制性酶切位點上堿基的插入、缺失、失重排或點突變所引起的
RAPD(随機擴增多态性DNA) 是建立在PCR基礎之上的一種可對整個未知序列的基因組進行多态性分析的分子技術,可用來鑒别個體,常規遺傳學分析,群體遺傳的研究。多用于植物基因組作圖
AFLP對基因組DNA進行酶切,連上雙鍊人工接頭,根據接頭的核苷酸序列和酶切位點設計引物,進行選擇性擴增。它将RAPD随機性和專一性擴增巧妙結合,再選用内切酶以達選擇的目的,結合了RFLP和PCR技術的特點,具有RFLP技術的可靠性和PCR技術高效性
SNP(單個核苷酸的多态性) 在不同個體之的基因組之間某一位點的單個堿基不同,在群體中形成了多态性
變性 加熱或用堿處理雙鍊DNA,使氫鍊斷裂,結果DNA變成為單鍊
複性 也稱為退火,變性DNA 在适當條件下,二條互補鍊全部或部分恢複到天然雙螺旋結構的現象,它是變性的一種逆轉過程
Tm值 雙鍊DNA變性中點時的溫度
分子雜交 來源不同的兩條單鍊核酸分子通過堿基互補形成異源雙螺旋分子
反向遺傳學 在已知基因序列的基礎上研究基因的生物學規律,通過功能喪失突變體研究其表型效應。通過同源重組,用突變的基因取代野生型基因,導緻功能喪失突變體,進行反向遺傳學研究
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