農村合作醫療可以減輕患者經濟負擔，讓參合人員享受大病保險跨省就醫補償政策。農村合作醫療參合人員可以享受基本醫保補償費用、大病保險補償費用和總補償費用。簡而言之，當參合人員患有大病時，國家根據病種給予報銷。
農村合作醫療采用按病種付費、按人頭付費、按床日付費等複合型支付方式，為參合人員提供醫療保障。參合人員不僅可以在省内就醫報銷，還可以在跨省定點就醫結報。
農村合作醫療提供的大病保障：兒童急性淋巴細胞白血病、兒童急性早幼粒細胞白血病、兒童先天性心髒房間間隔缺損、兒童先天性心髒室内間隔缺損、食管癌、胃癌、結腸癌、直腸癌、終末期腎病等。
農村合作醫療實行按病種付費，結合臨床路徑管理，逐步擴大按病種付費對大病病種的覆蓋面。農村居民參與農村合作醫療後，如果患有相關重大疾病，國家将給予報銷，減輕參合人員的經濟壓力。
農村合作醫療實行後，減少了農村居民有病不就醫、有病不願醫的情況。農村居民應當積極參與農村合作醫療。
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