1、枝尖插植繁殖。輪葉黑藻屬于“假根尖”植物，隻有須狀不定根，在每年的4～8月，處于營養生長階段，枝尖插植3天後就能生根，形成新的植株。
2、營養體移栽繁殖。一般在谷雨前後，将池塘水排幹，留底泥10～15厘米，将長至15厘米輪葉黑藻切成長8厘米左右的段節，每畝按30～50千克均勻潑灑，使莖節部分浸入泥中，再将池塘水加至15厘米深。約20天後全池都覆蓋着新生的輪葉黑藻，可将水加至30厘米，以後逐步加深池水，不使水草露出水面。移植初期應保持水質清新，不能幹水，不宜使用化肥。如有青苔滋生，可使用殺青苔藥物殺滅。
3、芽苞的種植。每年的12月到翌年3月是輪葉黑藻芽苞的播種期，應選擇晴天播種，播種前池水加注新水10厘米，每畝用種500～1000克，播種時應按行、株距50厘米将芽苞3～5粒插入泥中，或者拌泥沙撒播。當水溫升至15℃時，5～10天開始發芽，出苗率可達95%。
4、注意事項：①芽苞的選擇：芽苞長1～1.2厘米，直徑0.4～0.5厘米，每500克3500～4000粒，芽苞粒硬飽滿，呈蔥綠色。②播種前應用聚乙烯網片或白膜圍欄，将芽苞與河蟹隔開，待芽苞萌發長成，水草滿塘時，撤掉圍欄設施，讓河蟹進入草叢。③每畝放蟹量應在1000隻以下。
5、整株的種植。在每年的5～8月，天然水域中的輪葉黑藻已長成，長達40～60厘米，每畝蟹池一次放草100～200千克，一部分被蟹直接攝食，一部分生須根着泥存活。水質管理上，白天水深，晚間水淺，減少河蟹食草量，促進須根生成。
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