兩本書内容、作者、創作時間等不同。
《明史》,是清代官修的一部反映我國明朝1368至1644年曆史情況的紀傳體斷代史。全書336卷,其中目錄4卷、本紀24卷、志75卷、表13卷、列傳220卷,其卷數在二十四史中僅次于《宋史》,修纂時間之久,用力之勤卻大大超過了以前諸史。修成之後,得到後代史家的好評,認為它超越了宋、遼、金、元諸史。
《南明史》,是顧誠的代表作之一,1997年付梓。南明史全書記載自崇祯十七年即1644年大順軍陷北京至康熙三年即1664年夔東十三家進攻重慶之役最後敗亡為止的南明史迹。全書大約77萬字,建立在紮實史料之上,引用方志達237部,引用書目達579種。