蛋白質的一級結構決定于氨基酸的排列，蛋白質的空間結構決定于多肽鍊的折疊，盤繞方式。它是由基因上遺傳密碼的排列順序所決定的。各種氨基酸按遺傳密碼的順序，通過肽鍵連接起來，成為多肽鍊，故肽鍵是蛋白質結構中的主鍵。
蛋白質分子是由氨基酸首尾相連縮合而成的共價多肽鍊，但是天然蛋白質分子并不是走向随機的松散多肽鍊。每一種天然蛋白質都有自己特有的空間結構或稱三維結構，這種三維結構通常被稱為蛋白質的構象，即蛋白質的結構。蛋白質的一級結構就是蛋白質多肽鍊中氨基酸殘基的排列順序，也是蛋白質最基本的結構。它是由基因上遺傳密碼的排列順序所決定的。各種氨基酸按遺傳密碼的順序，通過肽鍵連接起來，成為多肽鍊，故肽鍵是蛋白質結構中的主鍵。
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