首先、在産前做診斷的時候，羊水穿刺做的最佳時間是在妊娠16～20周，在這個時候抽取羊水不會影響到女性正常的懷孕，因為這時胎兒小，羊水相對較多，胎兒漂在羊水中，周圍有較寬的羊水帶，用針穿刺抽取羊水時，不易刺傷胎兒。
其次、抽取20毫升羊水，隻占羊水總量的1/20～1/12，而且這個時期羊水中的活力細胞比例最大，細胞培養成活率高，可供制片、染色，作胎兒染色體核型分析、染色體遺傳病診斷和性别判定，也可用羊水細胞DNA做出基因病診斷、代謝病診斷。測定羊水中甲胎蛋白，還可診斷胎兒開放性神經管畸形等。
最後、穿刺羊水前，可讓孕婦卧床連續翻轉五次體位，使子宮内羊水中的胎兒細胞懸浮起來，方便穿刺抽取更多的胎兒細胞。采用B超探查确定腹部穿刺點(羊水多且無胎兒肢體處)，或在B超監測下實施穿刺。使用穿刺包按無菌要求消毒穿刺點，鋪洞巾，用穿刺針頭穿刺，緩緩抽取10-20毫升羊水，沿管壁緩緩注入無菌離心管，用無菌封口封好。
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