新疆醫科大學屬于烏魯木齊市新市區，具體地址是烏魯木齊市新市區新醫路393号。新疆醫科大學前身是始建于1954年的新疆醫學院，1956年建成招生，1998年6月新疆醫學院與新疆中醫學院合并成立了新疆醫科大學。
新疆醫科大學位于新疆烏魯木齊，是新疆唯一一所獨立建制的醫學院校，為省部委共建高校、卓越醫生教育培養計劃項目試點高校、自治區首批來疆留學高校示範基地。
1954年7月，新疆醫學院破土動工，自此，衛生部就從陸續自上海、沈陽、山東等地區選調了大批教師來到新疆醫學院，支援邊疆醫藥衛生教育事業的創建工作。
截至2021年5月，學校有6個國家級特色專業、1個國家級人才培養模式創新實驗區、6個自治區重點專業，建有2個國家級實驗教學示範中心。
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