蜥蜴用肺呼吸。蜥蜴屬于爬行動物，爬行動物一般都用肺來呼吸。蜥蜴也不例外，它們也是用肺呼吸的。因為它們是用肺呼吸的，所以它們不能在水中呼吸，隻能在陸地上呼吸。因此，它們是不能長時間泡在水裡的。它們對水的依賴性不強，有一些不太依賴水的蜥蜴品種，甚至可以在比較幹旱的沙漠裡面生存。
跟兩栖動物相比，蜥蜴的肺部結構比較複雜，功能也比較完善，隻借助肺部就可以順利呼吸，不用再借助其它器官輔助就能夠将足夠的氧氣供給身體的需要，并且将身體内部産生的二氧化碳排出體外。肺部這一構造是比較高等的動物才有的，因為肺部是一種高級構造，呼吸效率比較高。
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