方法一：疱疹認為是目前最有效的抗HSV藥物。病情嚴重者可靜脈給藥，劑量為每公斤體重5mg，每8小時1次，共5～7天。一般病人可口服，每次200mg，每日5次，或每次800mg，每日2次，共服5～7天。能使病毒迅速減少，症狀減輕，愈合時間縮短。外用3%～5%ACV軟膏也能減輕症狀和縮短病程。這個藥物到現在為止還對身體沒有什麼副作用。
方法二：對嚴重的原發性生殖器疱疹和反複發作的病人，可試用非特異性疫苗如卡介苗、脊髓灰質炎疫苗，以提高機體非特異性免疫力，可是這個治療效果還是有待提高的，有免疫抑制和免疫缺陷的病人慎用。
方法三：生殖器疱疹是一種頑固的疾病，很難将其根治，傳統藥物一直對于生殖器疱疹束手無策。外用富含活性極強的蛋白溶解酶，能快速溶解疱疹病毒的蛋白外殼，使藥物成份迅速進入病毒内部破壞基因鍊。抑制病毒的DNA多聚酶活性，使其無法繁殖、斷子絕孫。
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