1、抗菌素：鍊黴素30~50萬IU單位)、慶大黴素4~8萬IU單位)，混合溶解後灌服，每天2次，連服2~3天。
2、氟哌酸散：按仔豬每千克體重用藥0.3~0.5g，溫水溶解後灌服，每日2次，連服2~3天病重豬第1、第2方可并用)。
3、痢菌淨注射液：每頭仔豬肌肉注射2毫升，并内服黃連素片，每次1~2片每片0.5g)，每日2次，連服2~3天，療效較好。
4、對症治療：對嘔吐的仔豬每頭肌肉注射維生素B1注射液2~5毫升，每日2次，連注2天。對耳、鼻、四肢下部青紫者，肌肉注射10%磺胺密啶鈉注射液2~5毫升，每日2次，連注2天。對不吃不喝而脫水的仔豬，及時灌服葡萄糖，氯化鈉水溶液，補充體液，每次20毫升，每日5次，痊愈為止。
5、中藥輔助治療：黃連、大黃、烏梅各10克，白芍、地榆炭、甘草、柯子各15克，苦參、篇蓄、白頭翁、湘曲、藿香、車前子各20克，煎水服25情況豬的劑量)。
6、預防豬傳染性胃腸炎應堅持自繁自養，非購入不可時，則應嚴格檢疫，隔離觀察1個月以上，确實無病時方可合群。平時加強飼養管理，特别是寒冷季節，注意防寒保暖，保持豬舍幹燥、清潔衛生。一旦發現本病，立即嚴格隔離消毒。常用以下藥物中任一種進行消毒，1~2%燒堿溶液、10%漂白粉溶液、10~20%新鮮石灰乳、10~20%熱草木灰水及0.5~2%甲醛溶液，效果均很好。
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