首先、食物不耐受指的是一種複雜的變态反應性疾病，人的免疫系統把進入人體内的某種或多種食物當成有害物質，從而針對這些物質産生過度的保護性免疫反應，産生食物特異性IgG抗體，IgG抗體與食物顆粒形成免疫複合物(Ⅲ型變态反應)，可引起所有組織(包括血管)發生炎症反應，并表現為全身各系統的症狀與疾病。
其次、食物不耐受的産生原理當前仍然存在分歧，但是其存在的事實及産生的後果是公認的。這一研究領域現在得到較廣泛認可的是德國科學家FOOKE博士闡述的食物不耐受的發生原理。
最後、理論上食物在進入消化道後，應當被消化到氨基酸、甘油和單糖水平，這樣才能完全轉化為能量提供人體所需，但許多食物，因為缺乏相應的酶而無法被人體完全消化，以多肽或其他分子形式進入腸道，在那裡被機體作為外來物質識别，從而導緻免疫反應的發生，産生食物特異性的IgG抗體。而且相應的會在身體或是皮膚出現不正常的現象，這也是一種不适應或是不反應後的具體 表現。
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