１、營養成分的區别：青檸檬和黃檸檬雖然有着很多的區别，但它們兩者的營養成分卻是基本相同的，隻是青檸檬中的檸檬酸和維生素Ｃ含量稍高于黃檸檬。
２、顔色的區别：青檸檬并不是指尚未成熟的檸檬，而是檸檬家族中的一個獨立品種，它從挂果一直到成熟，其表皮都是青色的而且比較光滑。進口小青檸成熟後的果肉也是碧綠如玉，國産青檸成熟後的果肉則色如西柚，有點綠中帶黃的感覺。黃檸檬剛開始挂果時為青色，表皮上有比較細緻的紋理，成熟後外皮則變成金黃色，果肉也呈淺金黃色。
３、用途的區别：青檸檬的果汁比黃檸檬要多一些，皮也比黃檸檬要薄一些，最适合榨汁飲用或制作成酸味濃郁的果汁類飲料。青檸檬在泰菜或東南亞菜還常被當作調料使用，與魚類一起烹煮可以去腥味，與肉類一起烹煮能讓肉質松軟鮮美。黃檸檬在烹調中多用于西餐，通常也是榨成檸檬汁或切成檸檬片泡水飲用，用來搭配海鮮能起到去腥、吊鮮和增香的作用。
４、味道的區别：青檸檬的香味比較淺淡，國産青檸成熟後的果肉酸味也不重，而且回味稍帶有苦澀感。進口小青檸成熟後的果肉則味道極酸。黃檸檬的香味比較濃郁，成熟的果肉也是很酸的。
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