股票質押合同生效問題需要注意的有：
1、股票出質後，不得轉讓，但經出質人與質權人協商同意的可以轉讓；
2、禁止出質人在股票出質後将其股票轉讓給他人，但并不絕對；
3、上市公司與非上市公司的股票質押合同生效方式不一樣。
【法律依據】
根據《最高人民法院關于适用<華人民共和國擔保法>幹問題的解釋》第一百零三條，以股份有限公司的股份出質的，适用《中華人民共和國公司法》有關股份轉讓的規定。
以上市公司的股份出質的，質押合同自股份出質向證券登記機構辦理出質登記之日起生效。
以非上市公司的股份出質的，質押合同自股份出質記載于股東名冊之日起生效。
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