公訴轉自訴案件不适用反訴制度。公訴轉自訴案件其實是對公安機關、檢察院行為的一種審查，是一種監督糾錯機制。它本質上仍是公訴案件，隻不過賦予了被害人自訴的救濟權利，因此是不允許反訴的。
【法律依據】
《刑事訴訟法》第一百八十條規定，對于有被害人的案件，決定不起訴的，人民檢察院應當将不起訴決定書送達被害人。被害人如果不服，可以自收到決定書後七日以内向上一級人民檢察院申訴，請求提起公訴。人民檢察院應當将複查決定告知被害人。對人民檢察院維持不起訴決定的，被害人可以向人民法院起訴。被害人也可以不經申訴，直接向人民法院起訴。
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