1、線路不同:京九線線路呈南北走向,串聯中國華北、華中、華東和華南地區,是國家“八五”計劃的第一号工程。京廣線,是中國境内一條連接北京市與廣州市的國家Ⅰ級客貨共線鐵路;線路呈南北走向,串聯中國華北、華中和華南地區,為中國三橫五縱幹線鐵路網的一縱。
2、起止站點不同:京九線,北起北京西站,南至九龍站(港稱紅磡站);京廣線,北起北京豐台站,南至廣州站。
3、建立時間不同:京九線,1993年京九鐵路全線動工建設,于1996年9月1日全線開通運營,全長2407千米(幹線路段)。京廣線,1957年10月15日,武漢長江大橋建成投入使用,原京漢鐵路與粵漢鐵路合并成京廣鐵路,全長2294千米。