重元寺初名重玄寺，始建于梁武帝天監二年（公元503年），與寒山寺、靈岩寺及保聖寺同時代。梁武帝蕭衍以佛化治國。一時上行下效，全國崇佛。

　　某日傍晚，住在長洲縣衙西北二裡處的官員陸僧瓒，見官宅上空祥雲重疊，便突發奇想，立即奏請梁武帝，主動建議舍棄自家官宅，在原地改建一座寺廟，并為寺廟取名“重雲”。據記載，梁武帝欣然同意，并賜匾表示嘉許，匾額題為“大梁廣德重玄寺”。“重雲”被誤為“重玄”，是奏章轉抄上遞過程中的差錯。

　　重元寺一直興盛到中唐時代。公元842年，唐後期武宗會昌二年，中國曆史上最大的一次“滅佛”運動突然爆發。朝廷對僧人展開了殘酷的迫害和殺戮。蘇州城裡的寺廟大量被毀，僧人紛紛遷出城外，有的在别處另建新寺。離蘇州城三十裡的唯亭鎮便出現了一座新的重元寺。原名重元寺的上海靜安寺，建于唐會昌三年，很可能和唯亭重元寺是同一時期、同一背景下的産物。吳越錢镠時代（公元908－932年），曾對重元寺進行過大規模的修葺。重修後的重元寺，仍是一座“巨刹”，規模宏大，殿閣崇麗，寺前有兩座土山，兩塊異石立于庭前，一尊高丈餘的無量壽佛銅像屹立于中央，十六尊羅漢環立兩側。另有别院五座。

　　重元寺在宋朝改名為承天寺。宋宣和年間（公元1119－1125年），又因朝廷禁止寺觀橋梁以“天、聖、皇、王”等字命名，而改名為“能仁寺”。元代把重元寺在宋代的兩個名字合二為一，稱“承天能仁寺”。又有人叫它“雙峨寺”，這很可能是因為寺前有兩座土山，也可能是因為寺内兩塊異石的緣故。

　　清代因避康熙帝玄烨之諱，改“玄”為“元”，重元寺名就一直沿用。後重元寺在文革中完全損毀。2003年11月經江蘇省人民政府批準恢複重建重元寺，并于2007年11月17日隆重開光，寒山寺住持秋爽大和尚兼任住持。

　　史上重元寺作為禅宗的佛教場所，香火極盛。重建後的重元寺，地處風景秀麗的陽澄湖半島之中，最大的特色要屬水上觀音院内高達33米的觀音聖像了，是體現重元寺蓮花佛國、觀音道場獨特風貌的一處景觀。寺廟的建築有山門、天王殿、鐘鼓樓、大雄寶殿等。大雄寶殿建築面積達2100平方米，是國内寺廟中最大的單體建築。寺廟前的觀音島上供奉着目前中國室内最大的高33米的觀音主像。陽澄湖上遠眺重元寺，雄偉的大雄寶殿氣勢恢弘，飛檐翹角的觀音閣偉岸壯觀，加上寺院層層推進的主體建築和堪稱海内巨制的觀音像、銅腔皮革鼓、海島觀音壁以及能發出唐朝第一律第一聲的銅鐘等等，再現了當年重元寺的風采。

　　國内最高大的大雄寶殿

　　鐘樓中懸吊唐朝第一聲第一律梵音大鐘

　　鼓樓中安置有國内最大的銅腔皮革鼓

　　水天佛國廣場

　　觀音大士閣

　　國内最高的水上觀音閣

　　許願池

　　中國室内最大觀音主像

　　蘇州唯亭陽澄湖畔—重元寺

　　寒山書院

　　2019年10月，蘇州重元寺主動退出4A級景區，經江蘇省文化和旅遊廳複核檢查，已做出同意其退出的決定。

　　重元寺

　　重元寺的恢複重建填補了古城蘇州東面沒有寺廟的空白，建成後的重元寺将成為蘇州工業園區一道靓麗的風景線。

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