女性内分泌系統的功能主要是由下丘腦——垂體——卵巢軸所調節。下丘腦促性腺激素釋放激素可刺激垂體黃體生成素(LH)、促卵泡激素（FS H）的合成與釋放及誘發排卵，但當其超過正常時，則将抑制垂體LH、FSH 及卵巢雌孕激素的分泌，甚至可以抑制排卵。泌乳素增加可抑制促性腺激素LH、FSH的分泌，使卵泡不能正常發育及排卵。
FSH的作用主要是刺激卵泡的生長、發育和卵巢顆粒細胞的增生，排卵主要是LH的作用，在LH和一定比例FSH的影響下發生卵泡破裂和排卵，形成黃體，分泌雌孕激素。
下丘腦——垂體——卵巢軸有關器官的任何器質性疾病及任何環節功能失調均可導緻上述各種激素的分泌及相互調節的異常，最終将引起月經及排卵的異常而引起不孕症。常見的婦科内分泌疾病有功能失調性子宮出血、閉經、閉經泌乳綜合征、垂體泌乳素瘤、多囊卵巢綜合征等均可由于上述原因使患者不孕。
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