雖然大多數腹瀉都與胃腸道疾病直接相關，但也有些腹瀉是由其他髒器的疾患波及胃腸道而引起的。比如有些婦女在月經前期、月經期、經淨半個月後以及懷孕40天左右随着早孕反應的出現而發生腹瀉。
盆腔炎患者子宮後位盆腔充血（經前盆腔充血較重），子宮充血變軟，會更貼近直腸，壓迫骶神經産生下墜感，子宮壓擠直腸，刺激直腸粘膜收縮而引起排便。如果孕婦患有盆腔炎時，盆腔與子宮充血更明顯，炎症波及直腸，就會刺激直腸而發生腹瀉。這類腹瀉應該進行婦科檢查，确診患盆腔炎後就要積極地治療，注意糾正子宮後位，患者采取右側俯卧位也能減輕症狀。對可疑或确診為早孕的腹瀉用藥時應當慎重，以防止造成胎畸形。同時要注意加強孕期營養，以免發生營養不良性貧血及流産、早産等。
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