因為大多數免疫性不育是生殖器炎症引起的，如睾丸炎、附睾炎、精囊炎、前列腺炎等，因此用抗生素治療是必要的，治療後抗體顯著減少或消失。有的即使未發現明顯感染症狀，試用抗生素治療，抗體也會減少，可能有隐匿性生殖器炎症。
免疫抑制劑可用強地松5mg，每日3次，連服6個月；或地塞米松0 75m g，每日3次，1月後改為1日2次，1月後每日1次0.75mg維持，可連服3～6個月。大劑量短期沖擊療法比小劑量治療更為有效。在女方月經周期第21～ 26天，日服甲基強地松龍96毫克，在月經周期第15～20天中也要用小劑量維持連用1～3個月。
中藥可用：丹參30g，桃仁15g，赤芍15g，當歸12g，黃芪15g，枸杞子 30g，菟絲子20g，鹿角霜15g，益智仁12g，香附12g，每日一劑，水煎服， 30劑為1療程。有人用本方經1～3療程治療200例，抗精子抗體消失率達93 %。
對有自身抗精子抗體的精液，可經洗滌後作宮腔内人工授精。
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